Recessive genic male sterility (RGM

Recessive genic male sterility (RGMS) is common in plants and has been widely applied as an effective and economic system for hybrid seed production in many crops. However, little is known regarding the molecular mechanisms of RGMS in cabbage (Brassica oleracea L. var. capitata) due to limited transcriptomic and genomic data. Comparative transcriptomic analyses were performed on the sterile (RGMS632-MS) and fertile plants (RGMS632-SF) of a RGMS line (RGMS632) using second-generation Illumina sequencing to identify critical genes and pathways associated with male sterility. A total of approximately 109 million sequencing reads was obtained using RNA-seq. Abundance analysis identified a total of 5107 unigenes that showed significant differences between the two kinds of plants. Among these, 1558 genes were upregulated while 3549 genes were downregulated by more than twofold in RGMS632-MS compared to RGMS632-SF. KEGG pathway enrichment analysis revealed changes in the transcript abundance of genes involved in the metabolism and signal transduction of various phytohormones. The majority of hormone signalling pathways were downregulated in RGMS632-MS. Furthermore, a set of potential candidate genes involved in the formation or abortion of pollen were investigated. These results increased our understanding of the molecular mechanisms and biological processes in RGMS plants.

結果 (中文) 1:

隐性核不育 (RGMS) 是常见的植物和许多农作物杂交种子生产有效和经济系统已被广泛的应用。然而，是知之甚少关于 RGMS 白菜 （蓝 L.变种捲） 由于有限的转录组和基因组数据中的分子机制。对不育 (RGMS632-MS) 和肥沃的植物 (RGMS632-SF) 的 RGMS 线 (RGMS632) 使用第二代 Illumina 测序来识别关键基因和与雄性不育相关的通路进行了比较转录组分析。总面积约 1 亿 900 零万测序读取得到使用 RNA 序列元素丰度分析确定共 5107 unigenes 表明两种植物的显著差异。其中，1558年基因被上调虽然 3549 基因的氪更多地在 RGMS632 女士相比，RGMS632-SF.KEGG 通路富集分析双重显示变化中各种激素的代谢和信号转导相关基因的转录丰度。激素信号通路绝大多数都是在 RGMS632 女士氪。此外，考察了一组潜在候选基因参与形成或花粉败育。这些结果增加我们的分子机制和 RGMS 植物中的生物过程的理解。

結果 (中文) 2:

隐性核雄性不育（RGMS）是常见的植物，并已作为杂交种子生产的许多作物有效和经济体制得到广泛的应用。然而，很少关于白菜由于有限的转录组和基因组数据RGMS的分子机制（甘蓝变种结球甘蓝）闻名。比较转录组分析采用第二代Illumina的测序，发现关键基因，并与雄性不育相关的通路上RGMS线的无菌（RGMS632-MS）和肥沃的植物（RGMS632-SF）（RGMS632）进行。共约1.09亿测序读数是用RNA-SEQ获得。丰分析共5107个Unigenes这表明两种植物之间的差异显著确定。在这些当中，而3549个基因被超过两倍的RGMS632-MS下调相比RGMS632-SF 1558基因上调。KEGG通路富集分析揭示了在转录丰度参与各种植物激素的代谢和信号转导的基因变化。大多数激素信号通路中RGMS632-MS进行下调。此外，一组涉及的形成或花粉的流产潜在候选基因进行了研究。这些结果增加了我们在RGMS植物的分子机制和生物学过程的理解。大多数激素信号通路中RGMS632-MS进行下调。此外，一组涉及的形成或花粉的流产潜在候选基因进行了研究。这些结果增加了我们在RGMS植物的分子机制和生物学过程的理解。大多数激素信号通路中RGMS632-MS进行下调。此外，一组涉及的形成或花粉的流产潜在候选基因进行了研究。这些结果增加了我们在RGMS植物的分子机制和生物学过程的理解。

結果 (中文) 3:

隐性细胞核雄性不育（RGMS）是常见的植物，已在许多作物杂交种子生产的有效和经济系统的广泛应用。然而，很少有关于甘蓝RGMS的分子机制（Brassica oleracea var. capitata）由于有限的转录组和基因组数据。比较转录组学分析对不育进行（rgms632-ms）与可育株（rgms632-sf）的一个隐性核不育（rgms632）采用第二代Illumina测序鉴定与男性不育相关的关键基因和途径。总共约1亿900万使用RNA-Seq测序得到的。丰度分析，共鉴定出5107个基因，表明两种植物之间的显著差异。其中，1558个基因表达上调，3549个基因表达的两倍以上rgms632-ms相比rgms632-sf。KEGG通路富集分析显示在转录丰度的基因参与代谢和各种植物激素信号转导变化。大多数的激素信号转导通路的下调rgms632-ms.另外一组参与花粉的形成或流产的潜在候选基因进行了研究。这些结果增加了我们的分子机制及甘蓝植物生物学过程的理解。